Vorgeschichte

Naruto vereitelte die Pläne von Akatsuki. Da bekamen die anderen Ninjanationen Angst vor dem Feuerreich und es brach ein neuer Ninjakrieg aus. In diesem wurden viele Landstriche zerstört.
Mittlerweile hat sich die Welt beruhigt. Naruto, Kakashi, Sasuke und all die anderen sind auch schon tot. Es gibt nur noch die 5 großen Nationen Konohagakure, Sunagakure, Iwagakure, Kumogakure und Kirigakure, in welchem aber Bürgerkrieg herrscht. Unter den 5 großen Mächten herrscht jedoch Waffenruhe. Doch auch aus einem anderen Ort droht neue Gefahr. Akatsuki hat sich in Amegakure neu formiert und will den perfekten Ninja schaffen um der Welt Frieden zubringen. Dies wollen sie erreichen in dem sie die 5 Mächte zerstören und nur ein Land schaffen in dem Frieden und Ordnung herrscht. Um den perfekten Ninja zu erschaffen suchen sie auch das Sharingan, das es noch irgendwo vergraben und konserviert noch geben soll.Allerdings ist dies nicht der einzigste Weg auf dem Akatsuki probiert die Welt in die Dunkelheit zu stürzen. Sie suchen 6 Heilige Kugeln wovon jeweils eine in einem der 5 großen Ninja-Dörfer ist. Der Aufenthalt der 6. Kugel ist ihnen unbekannt, so dringen sie in Dörfer ein um die Kugeln zu finden. Falls sie alle 6 Kugeln finden sollten ist es ihnen möglich, dass Jutsu der absoluten Dunkelheit zu vollführen. Um die neue Bedrohung abzuwehren ist vom neuen der Zusammenhalt der Shinobis und Freundschaft gefragt.